Je pense aussi à une mycose installée sur des tissus nécrosés suite à de probables engelures.
Mais ce n'est pas trop grave, la tortue est jeune, et, après quelques bons soins, ce sera vite réglé.
Elle a de la chance d'avoir conservé toutes ses griffes et ses yeux, du moins, d'après ce que je vois sur les photos.